Участие и пособничество в деятельности организованного преступного сообщества, созданного с целью систематического совершения особо опасных преступлений, направленных против основ конституционного строя и безопасности государства, государственной власти и интересов государственной службы, правосудия, а также против мира и безопасности.

На основании опубликованных ранее материалов СМИ подозревается в захвате активов компании ЮКОС, инициировании их присвоения компанией «Роснефть», а также организации уголовных преследований в отношении акционеров ЮКОСа. Так, согласно мнению Михаила Ходорковского, Игорь Сечин является инициатором разгрома ЮКОСа и организатором уголовных дел против бывших акционеров компании.

Исходя из информации в открытых источниках, Сечин подозревается в рейдерском захвате с использованием административного ресурса, а также инспирировании уголовного преследования в отношении главы АФК «Система» Владимира Евтушенкова. Под предлогом иска о хищении средств в рамках нелегальной сделки о продаже «Башнефти» структурам АФК «Система» «Роснефть» Игоря Сечина получила контроль над очередным нефтяным активом всего за один день. В 2017 году «Роснефть» подала иск к АФК «Система» о возмещении ущерба во время реорганизации, приведшей к обесцениванию активов. Сумма иска составила 170 млрд рублей.

Предположительно, участвовал в сомнительных операциях по продаже акций компании «Роснефть», нанесших ущерб государству. В 2016 году «Роснефть» продала 19,5% активов консорциуму Glencore и суверенному фонду Катара. При этом компания «Роснефтегаз» перечислила в российский бюджет 717 млрд рублей в качестве дополнительного дивиденда за совершенную сделку, что на 2,6% меньше, чем предписывало правительство.

На основании информации СМИ, подозревается в инициации уголовного дела бывшего министра экономики Алексея Улюкаева. Расследование в отношении Улюкаева проводилось Олегом Феоктистовым — генералом ФСБ, работавшим с Сечиным с 2004 года. Предположительно, арест Улюкаева также связан с заявлениями в правительственных кругах о возможной передаче «Роснефти» в частные руки.

По данным WikiLeaks, Игорь Сечин также подозревается в использовании административного ресурса во время переговоров о покупке ТНК-BP Роснефтью. Так, он несет ответственность за преследования главы ТНК-BP Роберта Дадли, который в 2008 году был вынужден покинуть Россию, одновременно у британских сотрудников компании возникли проблемы с получением визы и разрешения на работу.

Сечин участвовал в биржевых спекуляциях, предположительно, повлекших за собой ущерб национальной экономике. В 2014 году, чтобы решить проблему с рефинансированием в размере 18 млрд долларов, Роснефть выпустила рублевые облигации, спровоцировав обвал рубля до рекордных значений. Реализация схемы проходила при поддержке российского правительства. Одним из бенефициаров данной операции стал банк «Открытие», который приобрел облигации Роснефти во время обвала рубля и за одну ночь удвоил свои активы.

По оценке Владимира Милова, вследствие личных коррупционных интересов Игоря Сечина «Роснефть» ежегодно теряет на экспорте нефти в Китай более 2,5 млрд долларов по сравнению с тем, что компания могла бы получать от поставок сырья в Европу.

Игорь Сечин, вероятно, мог использовать служебное положение в личных корыстных интересах и предоставлять преференций бизнес-структурам, принадлежащим его родственникам. По данным СМИ, бывшая супруга Сечина Марина контролирует компанию «Космосавиаспецстрой», получающую многомиллионные госконтракты в космической и оборонной промышленности.

Исходя из информации в открытых источниках, в действиях Сечина Игоря Ивановича могут содержаться признаки неосновательного обогащения; вероятно, он несет ответственность за нецелевое использование средств ПАО «НК „Роснефть“» и подозревается в присвоении (растрате) вверенного ему имущества. Стоимость аренды 5 га земли на Кутузовском проспекте под новый офис «Роснефти» составила 4,5 млрд рублей, что, по мнению экспертов, превышает рыночную цену в несколько раз.

Центр управления расследованиями (ЦУР) выяснил, что в 2015 году «Роснефть» выделила 170 млн рублей Михаилу Леонтьеву на поддержку журнала «Однако», который прекратил свое существование до срока завершения контракта.

В марте 2016 года аффилированная с «Роснефтью» офшорная компания Shelf Support Shiphold Limited (SSSL), зарегистрированная на острове Мэн, приобрела самолет Bombardier Global 6000 стоимостью около 55 млн долларов, который, по информации СМИ, используются Сечиным в личных целях. Согласно сайту госзакупок, «Роснефть» оформила договор фрахта, по которому обязуется платить за перелеты собственной дочерней компании. По данным ЦУРа, аренда самолета обходится приблизительно в 17 тыс. долларов в час.

В мае 2017 года стало известно о планах дочерней компании «Роснефти» приобрести предметы интерьера для вертолета на общую сумму в 5 млн рублей, в частности серебряные ложки по цене 15 тыс. рублей, стаканы по 11,7 тыс. рублей, икорницы по 83 тыс. рублей и пледы по 124 тыс. рублей.

По информации «Новой газеты», «Роснефть» под видом строительства «Полигона научного центра «Биосфера» в действительности возводит на территории Кавказского заповедника на западном склоне горы Фишт закрытый президентский горнолыжный комплекс. По данным Центра управления расследованиями, на курорт было потрачено 385 млн долларов «Роснефти». В несколько сотен миллионов рублей «Роснефти» обошлась установка линии спецсвязи от резиденции президента «Бочаров ручей» до горнолыжного комплекса.

По данным ЦУРа, бывший заместитель Сечина, Эдуард Худайнатов, в 2016 году приобрел более 200 га земли в Тверской области под строительство охотничьей усадьбы для Сечина, при этом захватив дорогу и берег Волги. В непосредственной близости земли с несколькими сотнями гектаров леса арендует охотничье хозяйство ООО «Профиль», принадлежащее компаниям, аффилированным с «Роснефтью» и «Трансмашхолдингом» Искандара Махмудова и Андрея Бокарева.

Игорь Сечин подозревается в том, что мог быть аффилирован с криминальным авторитетом Владимиром Барсуковым (Кумариным), который, согласно расследованию испанской прокуратуры, обеспечивал главу «Роснефти» деньгами.

Предположительно, мог использовать служебное положение для воспрепятствования работе российских СМИ. Игорь Сечин выиграл пять дел в российском суде против публикации информации в СМИ о деятельности его компании, а также его состоянии. Во время расследования, посвященного охотничьему хозяйству «Зубр», которое, вероятно, используется сотрудниками «Роснефти» и Игорем Сечиным, автомобиль журналистов ЦУРа был заблокирован двумя черными внедорожниками с символикой ООО «Зубр». В действиях сотрудников «Зубра» в отношении журналистов, предположительно, выступавших в интересах Игоря Сечина и Алексея Худайнатова, сына близкого друга Игоря Сечина Эдуарда Худайнатова, вероятно, имеются признаки нарушения статьи 119 УК РФ «Угроза убийством или причинением тяжкого вреда здоровью».

Согласно отчету аналитиков Sberbank CIB, Игорь Сечин является неэффективным менеджером «Роснефти»; так, несмотря на утверждение представителей «Роснефти», что чистый долг компании составляет 37,5 млрд долларов, аналитики оценивают сумму задолженности в более чем 73 млрд долларов.

В 2017 году «Роснефть» предоставила кредит в размере 6 млрд долларов венесуэльской госкомпании PDVSA за будущие нефтяные поставки. Несмотря на экономический кризис и высокую инфляцию, «Роснефть» ожидает, что PDVSA удастся погасить долг по предоплате к 2019 году. Согласно оценке экспертов, сделка с PDVSA является экономически нецелесообразной, в том числе из-за внутриполитического кризиса, происходящего в Венесуэле. Только в 2017 году «Роснефть» инвестировала 95 млрд рублей в пять венесуэльских проектов по добыче нефти, которые реализуются совместно с PDVSA.

Игорь Сечин может подозреваться в совершении преступной халатности. В 2017 году «Роснефть» договорилась с правительством Курдистана о закупке и продаже нефти на условиях предоплаты. Общая сумма сделки превысила 3 млрд долларов. Компания собиралась закупать до 70% нефти, внеся аванс в размере 2,1 млрд долларов. Осенью того же года курды потеряли главный источник доходов — нефтяные месторождения Киркука, перешедшие под контроль Ирака. Согласно заявлению главы комитета по финансам и экономике парламента Курдистана Иззата Сабера, курдское правительство не может выполнить обязательства перед «Роснефтью». Несмотря на заявления официального Багдада о незаконности сделки с Курдистаном и ее непрозрачности, иракские власти были готовы пойти на урегулирование конфликта при условии, что «Роснефть» будет согласовывать свои действия с компанией BP, которая располагает правом на разработку участков.

В действиях Игоря Сечина могут содержаться признаки следующих составов преступлений, предусмотренных УК РФ:

— Ст. 210 УК РФ «Организация преступного сообщества (преступной организации) или участие в нем (ней)», то есть участие в деятельности преступного сообщества, созданного с целью насильственного незаконного удержания власти вопреки требованиям Конституции РФ, и систематического совершения других преступлений против власти, правосудия, интересов службы и мира.

— Ст. 160 УК РФ «Присвоение или растрата, то есть хищение чужого имущества, вверенного виновному».

— Ст. 185.3 «Манипулирование рынком».

— Ст. 185.6 «Неправомерное использование инсайдерской информации».

— Ст. 285 УК РФ «Злоупотребление должностными полномочиями», то есть использование должностным лицом своих служебных полномочий вопреки интересам службы и с корыстной или иной личной заинтересованностью.

— Ст. 144 УК РФ «Воспрепятствование законной профессиональной деятельности журналистов», то есть воспрепятствование законной профессиональной деятельности журналистов путем принуждения их к распространению либо к отказу от распространения информации.

— Ст. 293 УК РФ «Халатность», то есть неисполнение или ненадлежащее исполнение должностным лицом своих обязанностей вследствие недобросовестного или небрежного отношения к службе либо обязанностей по должности, если это повлекло причинение крупного ущерба или существенное нарушение прав и законных интересов граждан или организаций либо охраняемых законом интересов общества или государства.