Участие и пособничество в деятельности организованного преступного сообщества, созданного с целью систематического совершения особо опасных преступлений, направленных против основ конституционного строя и безопасности государства, государственной власти и интересов государственной службы, правосудия, а также против мира и безопасности.

Исходя из данных открытых источников, предположительно, несет ответственность за неправомерные действия, совершенные ФСБ с 1999 по 2008 год, и разжигание вооруженного конфликта на Востоке Украины.

В ходе расследования по делу об отравлении бывшего сотрудника ФСБ Александра Литвиненко Высокий суд Великобритании установил, что убийство, вероятнее всего, было одобрено лично Патрушевым.

На основании информации СМИ, подозревается в том, что мог использовать служебное положение для оказания покровительства и содействия родственникам.

Россельхозбанк, возглавляемый сыном Николая Патрушева, кредитовал аффилированные с его семьей компании. Также Россельхозбанк мог быть связан с «Цапковской» ОПГ.

В действиях Николая Патрушева могут содержаться признаки следующих составов преступлений, предусмотренных УК РФ:

— Ст. 210 УК РФ «Организация преступного сообщества (преступной организации) или участие в нем (ней)», то есть участие в деятельности преступного сообщества, созданного с целью насильственного незаконного удержания власти вопреки требованиям Конституции РФ и систематического совершения других преступлений против власти, правосудия, интересов службы и мира.

— Ст. 285 УК РФ «Злоупотребление должностными полномочиями», то есть использование должностным лицом своих служебных полномочий вопреки интересам службы и с корыстной или иной личной заинтересованностью.

— Ст. 353 УК РФ «Планирование, подготовка, развязывание или ведение агрессивной войны», в том числе осуществление агрессии в отношении Украины, а также необоснованное использование вооруженных сил Российской Федерации на территории других государств.