Участие и пособничество в деятельности организованного преступного сообщества, созданного с целью систематического совершения особо опасных преступлений, направленных против основ конституционного строя и безопасности государства, государственной власти и интересов государственной службы, правосудия, а также против мира и безопасности.

Исходя из опубликованных ранее в СМИ материалов, подозревается в рейдерском захвате «Банка Москвы». В 2011 году ВТБ выкупил у московского правительства 46,5% акций «Банка Москвы», а также блокпакет Столичной страховой группы, контролировавшей 17,5% банка. Вместо проведения открытого конкурса акции «Банка Москвы» были внесены правительством Москвы в уставный капитал Центральной топливной компании и проданы ею ВТБ. По словам Андрея Бородина, оценка банка со стороны покупателя (180–190 миллиардов рублей) была занижена — сами акционеры оценили стоимость банка в 240–270 миллиардов. По мнению Бородина, показатели ВТБ на момент сделки не позволили бы выкупить полный пакет акций «Банка Москвы» ввиду того, что после заключения соглашения норматив достаточности ВТБ упал бы ниже 8%, и ЦБ был бы вынужден отозвать лицензию банка в тот же день. Бывший совладелец «Банка Москвы» также утверждает, что дважды предлагал представителям ВТБ выкупить пакет акций по цене, превышающей стоимость покупки, но они отказывались.

По данным Фонда борьбы с коррупцией, в июле 2007 года «ВТБ Лизинг», дочерняя компания банка ВТБ, была вовлечена в инцидент, связанный с покупкой 30 единиц бурового оборудования, в результате которой банк понес многомиллионные убытки.

Согласно газете «Коммерсант», в 2007 году ВТБ выставил 22,5% акций на продажу частным миноритариям. В ходе IPO акции банка приобрели около 130 тыс. человек по цене 13,6 копеек за штуку. В общей сложности ВТБ продал акции на сумму 8 млрд долларов, из которых 1,5 млрд приобрели физические лица. Летом того же года цена акций упала ниже первоначальной стоимости продажи, а к марту 2009 года их стоимость составила две копейки. В разгар кризиса частные акционеры обвиняли ВТБ в завышении изначальной цены акций, в бездействии и получении несоразмерных вознаграждений менеджерами банка. В феврале 2012 года, непосредственно перед президентскими выборами, Владимир Путин поручил ВТБ рассмотреть возможность обратного выкупа акций. Всего за неделю банк разработал механизм компенсации для частных миноритариев. С 12 марта по 13 апреля 2012 года ВТБ предложил обратный выкуп акций по цене покупки 2007 года (13,6 копеек), то есть значительно выше рыночной стоимости акций на тот момент (7 копеек за акцию). Как отмечает Forbes, нерыночная цена приобретения банком акций и поспешность организации процесса их выкупа указывает на политическую мотивированность решений, принимаемых менеджерами ВТБ, действующими исходя не из интересов акционеров, а с целью решения текущих проблем российской власти.

С 2013 по 2014 год три банка (ВТБ, Credit Suisse и BNP Paribas) привлекли кредиты на сумму 2 млрд долларов для фирм, принадлежащих Минобороны Мозамбика, которые заключили контракты на приобретение военного оборудования. Согласно расследованию агентства Kroll, Credit Suisse и ВТБ получили 200 млн долларов в качестве комиссионных. В 2017 году Минюст США и ФБР начали расследование в отношении роли банков, кредитовавших Минобороны Мозамбика, в содействии коррупции в стране.

В действиях Андрея Костина могут содержаться признаки следующих составов преступлений, предусмотренных УК РФ:

— Ст. 210 УК РФ «Организация преступного сообщества (преступной организации) или участие в нем (ней)», то есть участие в деятельности преступного сообщества, созданного с целью насильственного незаконного удержания власти вопреки требованиям Конституции РФ и систематического совершения других преступлений против власти, правосудия, интересов службы и мира.

— Ст. 158 УК РФ «Кража», то есть тайное хищение чужого имуществ. Объект хищения — государственная собственность.